1938年1月，新四軍軍部進駐巖寺，教導隊擴建為教導營。1938年9月，經(jīng)中共中央、中共中央軍事委員會批準，在教導營的基礎上又擴大建為新四軍教導總隊。教導總隊設在云嶺中村鄉(xiāng)董家村。教導總隊隊長周子昆，副總隊長兼教育長馮達飛在此居住和辦公。

教導總隊學員，除一部分來自新四軍各支隊的軍政干部，大多是來自江南各淪陷區(qū)（上海、鎮(zhèn)江、杭州、溫州、寧波等地）的抗日愛國青年，還有少數(shù)來自東南亞各國的愛國青年。教導總隊以“團結緊張、嚴肅活潑”為隊訓，以“為人民解放事業(yè)隨時準備犧牲自己”為宗旨，總計辦了六期，鼎盛時期曾設十三個分隊，新四軍教導總隊為新四軍培養(yǎng)了大批軍政人才，被譽為“皖南抗大”畢業(yè)的學員達4000余人。